Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scg2Q03517 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms