Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms