Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms