Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gjb5Q02739 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb5Q02739 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms