Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pax5Q02650 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms