Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrkcqQ02111 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms