Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms