Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pde1bQ01065 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms