Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms