Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
rp9P97762 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
rp9P97762 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
rp9P97762 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
rp9P97762 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
rp9P97762 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms