Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cmklr1P97468 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cmklr1P97468 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cmklr1P97468 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cmklr1P97468 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cmklr1P97468 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cmklr1P97468 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cmklr1P97468 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cmklr1P97468 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cmklr1P97468 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cmklr1P97468 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cmklr1P97468 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cmklr1P97468 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Cmklr1P97468 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cmklr1P97468 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms