Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll3P85442 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll3P85442 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms