Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irx3P81067 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irx3P81067 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx3P81067 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms