Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Q6P79568 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-Q6P79568 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms