Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms