Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Plxna3P70208 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms