Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf5P70191 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf5P70191 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf5P70191 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms