Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tubb4bP68372 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb4bP68372 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms