Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Polr2lP62876 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr2lP62876 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms