Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rps28P62858 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms