Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copz1P61924 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms