Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Paxbp1P58501 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Paxbp1P58501 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms