Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gsc2P56916 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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