Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1P55194 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1P55194 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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