Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad23aP54726 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms