Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fdft1P53798 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms