Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fgd1P52734 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms