Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upp1P52624 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms