Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClgnP52194 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClgnP52194 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms