Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpbP50405 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SftpbP50405 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms