Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psen1P49769 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms