Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CenpcP49452 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms