Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtpreP49446 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms