Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLMP48507 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLMP48507 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLMP48507 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GCLMP48507 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GCLMP48507 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLMP48507 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GCLMP48507 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms