Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prox1P48437 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms