Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epb41P48193 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epb41P48193 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms