Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gdf5P43027 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf5P43027 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms