Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mmp9P41245 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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