Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Traf2P39429 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf2P39429 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf2P39429 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms