Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TtlP38585 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TtlP38585 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TtlP38585 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TtlP38585 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TtlP38585 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TtlP38585 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TtlP38585 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TtlP38585 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TtlP38585 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtlP38585 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtlP38585 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtlP38585 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtlP38585 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtlP38585 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtlP38585 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TtlP38585 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms