Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc5P32043 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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