Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Saa4P31532 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Saa4P31532 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms