Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms