Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd3P30282 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms