Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apex1P28352 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apex1P28352 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms