Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Etv4P28322 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Etv4P28322 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms