Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa2P28309 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms