Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmb9P28076 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmb9P28076 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmb9P28076 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms