Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gria1P23818 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms