Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm26623-201ENSMUST00000180911 850 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Cd40lg-201ENSMUST00000033466 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd11P23813 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm17026-201ENSMUST00000166674 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm17124-201ENSMUST00000168320 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd11P23813 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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